Bueno si tienes ubuntu 7.10 compiz ya viene por defecto lo unico que tendrias que hacer es instalar el setin-manager.
Pero si usas el 7.04 date una pasada por aqui
http://www.elblogdemaverick.com/?p=200.
trata de dar mas informacion de tu problema eso de los bordes de ventanas tiene solucion los repositorios de treviño son muy buenos.
pdt; san google es muy util recuerda.