para leer y escribir particiones ntfs se usa el "driver" ntfs-3g. esta en los repos, y una vez instalado, las particiones se montan con el comando mount NORMAL, o bien, especificando el driver (ntfs-3g) en el fstab.
lo del ntfs-config, la primera vez que lo oigo. (y si, tengo mis particiones ntfs que leo y escribo sin problemas. )
PD: gksu?? prueba con sudo. no tiene ni pies ni cabeza usar un sudo grafico para lanzar algo desde consola.