Buenas resulta que tengo este proyecto pero la verdad ando un poco perdido en el tema me podrían decir de que va o por
lo menos por donde empezar. Me seria de gran ayudaaa, gracias.
Estas son las instrucciones:

Supongo es tarea escolar universitaria, dejame decirte que esta bastante pesadito y extenso el proyecto para universitarios, pero en fin hay cada loco con titulo de catedratico, y te digo esto por aquello de que mencionas que "andas un poco perdido". Para que un profesor te deje un proyecto asi debes de tener ya fundamentos de todo lo que te piden.

debes documentarte y leer muchisimo, muhco en verdad.

Empieza por:
Para implementa la red en maquinas virtuales, lee sobre Virtual box en Linux
Para direcciones automáticas e interconecciones entre maquinas lee sobre como monta servidor DHCP en linux
Para cuentas lee como montar un active directory con samba (te servira para añadir clientes win)
Para bloqueo sobre Iptables
Para el sitio web, instala LAMP + WP
para ftp instala el servicio vsftpd
para impresiones samba y CUPS
acceso remoto SSH

Suerte.