Igual es un poco tarde para responder al hilo, pero para personalizar ubuntu existe el uck ubuntu costumization kit (
http://uck.sourceforge.net/) al cual le pasas una iso de ubuntu y te permite instalar y desinstalar paquetes, modificar archivos, etc.
Va estupendamente y es muy facil de usar, solo requieres de unos 4gb como mínimo de espacio en el sistema