una vez hice un programa en VB 6.0 con bases de datos Acces y funcionaba bien,
lo corrí con Wine (no recuerdo la versión) en Debian Etch (hace como 3 años) todo se ejecutaba bien, aclaro solo eran cosas de meter datos en la base, editar los datos, sacar uno que otro promedio, podria decir que era un sistema de notas(almenos pretendía serlo hehe) todo el código (ya compilado) funcionaba bien con wine y las bases de datos Acces solo se copiaban e igualmente funcionaban.
Si es algo simple (inventario, cosas de contabilidad, etc) entonces intenta, haber si sirve, si no sirve así nada más, tendrías que pasar todo a Gambas como te han recomendado antes y usar bases de datos compatibles y todo eso (podría tomarte algo de tiempo, o puede que no, eso depende de que tan grande es el sistema que quieren hacer y cuanto personal disponible este) solo eso se me ocurre

... suerte
