Hola Akodo,
Muchas gracias por tu respuesta.
La verdad es que me has dado una idea ya que la siguiente línea (la pongo por si le sirve a alguien más) envia el contenido del archivo my.cnf por mail, lo que no sé ahora es como guardar la salida del script en un archivo.
cat /etc/my.cnf | mail -s "asunto"
email@dominio.com