Hola a todos, como ya supondréis soy nuevo "en este mundillo" y no se exactamente que me esta pasando.
He usado clonezilla para hacer una imagen del disco A al disco B.
Los dos están dentro del pc y mi idea es precisamente esa, usar el segundo disco para copias y cosas asi.
El caso es que después de terminar clonezilla me arranca desde el disco B.
He cambiado en Bios, pero sigue ocurriendo
Si desconecto el disco B (le quito el cable de datos) arranca desde A sin problema, pero si lo conecto, otra vez va al segundo.
Al arrancar desde B , el A aparece desmontado.
Agraceria mucho ideas de lo que pasa y sobre todo sugerencias de como reparar el tema.
Quizas Clonezilla no es el programa que tendria que haber usado....¡no se!..
Si teneis alguna recomendación para hacer imagen iso, también quedaría agradecido.
Gracias por anticipado.

a ver, por partes... Primero, ¿qué tienes instalado? (qué distribuciones, donde , etc, etc. Si tienes algo de Linux, el comando
sudo fdisk -l
te dirá (y nos podrás informar) de cómo están particionados tus discos, cual es la partición de arranque, etc.

Y segundo ¿qué quieres hacer exactamente? (Clonezilla te crea una imagen de un disco, o una partición que, debidamente guardada, te servirá para restaurarla y volver, así, a la situación que tenia esa partición/disco cuando creaste la copia). No creo que haga nada de eso que dices que te cambia el arranque.

Muchas palabras para decir nada interesante, hubiese estado bueno que dieras características de la maquina, así que mi respuesta va a ser genérica.-

En un equipo que use discos mesclados sata, ide, siempre después de un corte de luz o con el tiempo, el ide toma el control y si tiene un SO lo arranca.-
En un equipo que use discos sata solamente, va a tener el control siempre el que se encuentre conectado en sata0 o sata1 depende de como lo defina el motherboard, al sata principal.-
En ambos casos nada tiene que ver clonezilla, sino que depende de la bios cual disco esta marcado como principal, y en los sata depende de como estén conectados.-

Es verdad!!, supongo que no he sabido explicarme.
De todas formas gracias por las respuestas.
Al final he creado un livecd y entrando al sistema con el, he formateado el segundo disco y problema resuelto.
Gracias otra vez.