no debe de haber problemas para tener los dos instalados. nunca he tenido gnome y kde juntos porque para empezar no me gusta kde, pero en estos momentos tengo gnome 3 y E17 juntos en Debian y se llevan muy bien

.
teniendo gdm o algo parecido puedes arrancar el entorno de escritorio que quieres usar.
pero bueno espera haber que te comentan
