la instalación de kde 3.5 requiere desinstalar el antiguo kde antes de continuar, por lo que creo que para Gnome debe ser igual.
Asi que debes ya sea usar el modo consola para desinstalar y luego instalar la nueva versión de Gnome (necesitas saber manejarte con comandos), o usar algún otro entorno gráfico para hacerlo (ya sea que tengas el kde o instales el icewm).
el paquete principal para iniciar la instalación de gnome de los repositorios mandriva es
gnome2-2.10.2-1mdk
ese paquete es un paquete virtual, es decir contiene sólo los datos de lo necesario para tener el escritorio con lo minimo
en el caso de los repositorios SoS hay dos paquetes
gnome2-2.10.2-1.2006.SoS.noarch.rpm
gnome-desktop-2.13.3-1.2006.SoS.i586.rpm
el primero si te fijas, tiene la misma versión que el paquete oficial, asi que no se si sea para actualizar y como referencia, o quizá debas utilizar el segundo paquete el cual ya tiene una versión diferente.
Debes tener cuidado en que instalas y sus versiones, ya que en SoS hay dos versiones, la
2.13.1-1.2006.SoS.i586.rpm
y
2.13.3-1.2006.SoS.i586.rpm y todo lo que instales debe ser de una única versión.
por tu pregunta inicial parece que quieres descagar directamente de SoS, pero si lo haces añadiendo SoS a tus repositorios el urpmi se encargara de instalar todo siguiendo un orden, sólo debes saber con cual orden comenzar
puede ser
urpmi gnome2-2.10.2-1.2006.SoS.noarch.rpm si es correcto (lo cual hace dudar por el número de versión que tiene) y ese paquete es para cambiar de versión te dira que requiere de más paquetes los cuales deben ser de 2.13
la otra opción puede ser urpmi gnome-desktop-2.13.3-1.2006.SoS.i586.rpm igualmente debe pedirte poder instalar otros paquetes y eso es todo.
La forma más fácil de salir de dudas es usar el modo gráfico de urpmi (rpmdrake) y ver la descripción de cada paquete
